BoxB是HMGB1蛋白的DNA结合域之一。它由90个氨基酸组成,计算的分子量约为10kDa。人和小鼠的BoxB序列完全相同;该产物含有4个氨基酸(MARI),这些氨基酸已被添加在N端,以便在细菌中表达。它只含有微量的LPS(<0.4ng/mg蛋白)。